我国科研人员发布可让蛋白质“定向进化”的大模型
作为生物体的定向进化基本组成部分,蛋白质广泛存在于人们生产生活中。国科3月22日,研人AG超玩会入口上海交通大学特聘教授洪亮团队发布了蛋白质设计大模型Venus,布可白质其核心能力是让蛋让蛋白质实现功能的“定向进化”。该模型设计的模型多款产品已进入产业应用。
洪亮表示,定向进化自然界中参与构成蛋白质的国科氨基酸有20种,一个蛋白质分子一般由几十个乃至数百个氨基酸组成,研人而蛋白质的布可白质功能则包含热稳定性、活性、让蛋AG超玩会入口亲和力等。模型
洪亮团队发布蛋白质设计大模型Venus(受访者供图)
据介绍,定向进化与以往靠经验和高通量实验的国科传统方法相比,大模型Venus能完成蛋白质从序列到功能的研人预测,实现了从“大海捞针”到精准设计。如果想要强化目标蛋白质的某个功能,只需要提供该蛋白质的序列信息,Venus就可以快速给出一批蛋白质序列改造方案,随后结合实验验证得到最优改造方案。
“数据是大模型的基础,我们建立了包含数十亿条蛋白质序列的数据集,覆盖从常规地表生物到极端环境微生物的蛋白质序列信息,其中数亿条蛋白质序列具有功能标签。”洪亮说。
洪亮表示,基于海量功能未知的蛋白质数据集,精准发掘满足苛刻应用需求的、具备超常规功能的蛋白质,是Venus的另一核心功能,有望开发这些蛋白质在生物技术、医药研发和工业生产中的应用潜力。
“蛋白质设计大模型的突破,不仅开辟了蛋白质从序列到功能的科学研究新方向,还打通了人工智能与生物交叉的工程化应用之路。”上海交通大学自然科学研究院院长金石说。
据介绍,Venus设计的多款蛋白质已进入产业化阶段,例如活性高、稳定性强、产物纯的PET降解酶,用于超敏检测诊断的高活性碱性磷酸酶等。(记者董雪)
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